Ως ύποπτος για απάτη και ξέπλυμα χρήματος αναφορικά με την ανάθεση του Παγκοσμίου Κυπέλλου του 2006 στη Γερμανία κατηγορείται ο Γερμανός
Έπειτα από τις έρευνες που έχουν πραγματοποιηθεί από τις ελβετικές Αρχές, φανερώθηκε κατάθεση σε λογαριασμό του σε τράπεζα του Γιβραλτάρ από την Παγκόσμια Ομοσπονδία. Αλλωστε, ο Γερμανός παράγοντας ήταν μέλος της εκτελεστικής επιτροπής της FIFA από το 2007 μέχρι το 2011.
Η εισαγγελία τον κάλεσε για κατάθεση και σε αυτή, ο Μπεκενμπάουερ απάντησε σε ό,τι ρωτήθηκε, ήταν συνεργάσιμος, όπως προκύπτει από το γραφείο Τύπου της εισαγγελίας, όμως συνεχίζει ν’ αρνείται οποιαδήποτε ανάμειξή του σε υπόθεση διαφθοράς.